使用特定的计价软件，违反规定吗？

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明显违反公平竞争的规定。
《公平竞争审查制度实施细则(暂行)》(发改价监[2017]1849号)
第三章 审查标准
      第十四条 市场准入和退出标准。
（三）不得限定经营、购买、使用特定经营者提供的商品和服务，包括但不限于： 1.以明确要求、暗示、拒绝或者拖延行政审批、重复检查、不予接入平台或者网络等方式，限定或者变相限定经营、购买、使用特定经营者提供的商品和服务； 2.在招标投标中限定投标人所在地、所有制、组织形式，排斥或者限制潜在投标人参与招标投标活动； 3.没有法律法规依据，通过设置项目库、名录库等方式，排斥或者限制潜在经营者提供商品和服务。

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反垄断法(主席令68号)   第三十二条 行政机关和法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织不得滥用行政权力，限定或者变相限定单位或者个人经营、购买、使用其指定的经营者提供的商品。

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bob1511 发表于 2018-10-19 09:29
这两个法律规定针对的都是行政部门，行政部门在制定政策法规时不得违反上述两条。

招标文件不是需要经有关行政监督部门备案审核的吗。
就算不需要，相关行政监督部门依据以上法规和规范性文件，责令招标人终止招标，修改招标文件，重新招标。
相关投标人可到发改（或招标文件备案监督部门）投诉，要求终止招标。